プログラミング-neuroscience

MCCの計算

この指標は普通は使わない気がする。 class MCC: def conf(self, psp_true, psp_pred): """ psp_true: shape = (n_data, 1) のarrayとして渡す """ #==== epsp ==== y_true = np.ravel(psp_true) y_pred = np.ravel(psp_pred) tp_epsp = (y_true >= 1) & (y_…

spike trainのファイルを読み込む

spike時刻がneuronごとに";"区切りで, 縦に並んで記録されている時にデータを読み込む def load_data(filepath, format="list"): """ ;区切りのデータをnumpyで扱える形に読み込む データはlistでここの要素はspike time """ with open(filepath, "r") as f:…